Wahyu Widdodo mendapatkan gelar doktoralnya di Leiden Universiteit, Belanda pada 10 April 2025 dengan judul disertasi “The Unseen Saints of Islam: Sufi Ritual and Religious Worldmaking in Java”. Sejak 2011, Ia adalah dosen tetap di Fakultas Ilmu Budaya, Universitas Brawijaya, Malang.
